Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms