Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms