Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD163L1Q9NR16 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms