Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31BQ9NQW1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms