Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms