Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM12Q9H4Q4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM12Q9H4Q4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM12Q9H4Q4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM12Q9H4Q4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM12Q9H4Q4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM12Q9H4Q4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM12Q9H4Q4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM12Q9H4Q4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms