Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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