Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms