Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TGS1Q96RS0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGS1Q96RS0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms