Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5RAP3Q96JB5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK5RAP3Q96JB5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms