Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAX2Q96IS3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms