Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP31Q70CQ4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
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