Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms