Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOCADQ5VW36 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms