Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PHYHD1Q5SRE7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms