Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPHKAPQ2M3C7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPHKAPQ2M3C7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms