Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf58Q2M2W7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms