Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KNOP1Q1ED39 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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