Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RYR3Q15413 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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