Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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GBX1Q14549 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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GBX1Q14549 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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GBX1Q14549 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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GBX1Q14549 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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GBX1Q14549 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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GBX1Q14549 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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GBX1Q14549 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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GBX1Q14549 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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GBX1Q14549 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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GBX1Q14549 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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GBX1Q14549 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
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