Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSLNQ13421 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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