Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
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