Protein–RNA interactions for Protein: Q12507

SFG1, Superficial pseudohyphal growth protein 1, yeastyeast

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SFG1Q12507 YDR048CYDR048C 315 nt0.68□□□□□ -2.3
SFG1Q12507 YPR012WYPR012W 255 nt0.68□□□□□ -2.3
SFG1Q12507 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.68□□□□□ -2.3
SFG1Q12507 NHP2YDL208W 471 nt0.67□□□□□ -2.3
SFG1Q12507 TAR1YLR154W-C 375 nt0.66□□□□□ -2.3
SFG1Q12507 YOR218CYOR218C 420 nt0.66□□□□□ -2.3
SFG1Q12507 YPL225WYPL225W 441 nt0.66□□□□□ -2.3
SFG1Q12507 SSS1YDR086C 243 nt0.65□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 YNL211CYNL211C 261 nt0.65□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 PRP16YKR086W 3216 nt0.64□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 PAU12YGR294W 363 nt0.64□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 YMR321CYMR321C 318 nt0.64□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 SGF11YPL047W 300 nt0.64□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.63□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.62□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 CHS6YJL099W 2241 nt0.62□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 YML002WYML002W 2214 nt0.62□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.61□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.61□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.61□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.61□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.61□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.61□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 LTE1YAL024C 4308 nt0.61□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 SEC8YPR055W 3198 nt0.61□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 UTP10YJL109C 5310 nt0.6□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 ASE1YOR058C 2658 nt0.6□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 YAF9YNL107W 681 nt0.6□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 CSE2YNR010W 450 nt0.6□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 QCR9YGR183C 201 nt0.59□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 YPR197CYPR197C 564 nt0.59□□□□□ -2.31
SFG1Q12507 COG8YML071C 1824 nt0.59□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 YDR102CYDR102C 333 nt0.58□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.58□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.57□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 COX5BYIL111W 456 nt0.57□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.57□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.57□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 RPS27BYHR021C 249 nt0.56□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.55□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.55□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 YOL014WYOL014W 375 nt0.55□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 FYV10YIL097W 1551 nt0.54□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 HTL1YCR020W-B 237 nt0.54□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.54□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.54□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 snR60snR60 104 nt0.53□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.53□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.53□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.53□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 VIK1YPL253C 1944 nt0.53□□□□□ -2.32
SFG1Q12507 PET111YMR257C 2403 nt0.53□□□□□ -2.33
SFG1Q12507 snR190snR190 190 nt0.52□□□□□ -2.33
SFG1Q12507 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.51□□□□□ -2.33
SFG1Q12507 YIL032CYIL032C 357 nt0.51□□□□□ -2.33
SFG1Q12507 snR36snR36 182 nt0.5□□□□□ -2.33
SFG1Q12507 MLP1YKR095W 5628 nt0.49□□□□□ -2.33
SFG1Q12507 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.49□□□□□ -2.33
SFG1Q12507 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.49□□□□□ -2.33
SFG1Q12507 PRP5YBR237W 2550 nt0.49□□□□□ -2.33
SFG1Q12507 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.48□□□□□ -2.33
SFG1Q12507 YKL136WYKL136W 399 nt0.48□□□□□ -2.33
SFG1Q12507 YGL149WYGL149W 306 nt0.47□□□□□ -2.33
SFG1Q12507 OST4YDL232W 111 nt0.46□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.46□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.46□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 TRS65YGR166W 1683 nt0.46□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 PRP42YDR235W 1635 nt0.46□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 ULP2YIL031W 3105 nt0.45□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 ATP6Q0085 780 nt0.45□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 YFL063WYFL063W 456 nt0.45□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 HAL9YOL089C 3093 nt0.45□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 AI1Q0050 2505 nt0.44□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 GIM4YEL003W 336 nt0.44□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 MYO1YHR023W 5787 nt0.44□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 SBH1YER087C-B 249 nt0.43□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 YFL032WYFL032W 321 nt0.43□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.42□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.42□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 YLR282CYLR282C 342 nt0.42□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 YNL028WYNL028W 318 nt0.42□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 BEM3YPL115C 3387 nt0.42□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 COY1YKL179C 2040 nt0.42□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 HMRA1YCR097W 381 nt0.41□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.41□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.41□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 YOR345CYOR345C 351 nt0.41□□□□□ -2.34
SFG1Q12507 snR56snR56 88 nt0.4□□□□□ -2.35
SFG1Q12507 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.4□□□□□ -2.35
SFG1Q12507 BIR1YJR089W 2865 nt0.4□□□□□ -2.35
SFG1Q12507 YKL118WYKL118W 312 nt0.39□□□□□ -2.35
SFG1Q12507 FMP27YLR454W 7887 nt0.38□□□□□ -2.35
SFG1Q12507 YDR413CYDR413C 576 nt0.38□□□□□ -2.35
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