Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms