Protein–RNA interactions for Protein: Q08641

ABP140, tRNA(Thr) (cytosine(32)-N(3))-methyltransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ABP140Q08641 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.04□□□□□ -2.4
ABP140Q08641 TAR1YLR154W-C 375 nt0.04□□□□□ -2.4
ABP140Q08641 YAR047CYAR047C 321 nt0.04□□□□□ -2.4
ABP140Q08641 TOM22YNL131W 459 nt0.04□□□□□ -2.4
ABP140Q08641 SGF11YPL047W 300 nt0.04□□□□□ -2.4
ABP140Q08641 RPS26AYGL189C 360 nt0.03□□□□□ -2.4
ABP140Q08641 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.03□□□□□ -2.4
ABP140Q08641 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.03□□□□□ -2.4
ABP140Q08641 BUL2YML111W 2763 nt0.03□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 YHR130CYHR130C 336 nt0.02□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.02□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 snR54snR54 86 nt0.02□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 YLR334CYLR334C 381 nt0.01□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.01□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 YNL122CYNL122C 348 nt0.01□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 MRPL50YNR022C 420 nt0.01□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 YPL225WYPL225W 441 nt0.01□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 YLR101CYLR101C 396 nt0□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 YNL146WYNL146W 303 nt0□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 YOR053WYOR053W 342 nt0□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 snR41snR41 95 nt0□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-0.01□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 snR190snR190 190 nt-0.01□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 COY1YKL179C 2040 nt-0.01□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 snR45snR45 172 nt-0.02□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 THO2YNL139C 4794 nt-0.03□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 YJL120WYJL120W 324 nt-0.03□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 YLR456WYLR456W 615 nt-0.03□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 YPL068CYPL068C 882 nt-0.03□□□□□ -2.41
ABP140Q08641 NNF2YGR089W 2811 nt-0.04□□□□□ -2.42
ABP140Q08641 ECL1YGR146C 636 nt-0.04□□□□□ -2.42
ABP140Q08641 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.05□□□□□ -2.42
ABP140Q08641 SSS1YDR086C 243 nt-0.05□□□□□ -2.42
ABP140Q08641 YER006C-AYER006C-A 318 nt-0.06□□□□□ -2.42
ABP140Q08641 RPS25BYLR333C 327 nt-0.06□□□□□ -2.42
ABP140Q08641 NIP1YMR309C 2439 nt-0.06□□□□□ -2.42
ABP140Q08641 HMRA2YCR096C 360 nt-0.07□□□□□ -2.42
ABP140Q08641 YPR092WYPR092W 306 nt-0.07□□□□□ -2.42
ABP140Q08641 SOV1YMR066W 2697 nt-0.07□□□□□ -2.42
ABP140Q08641 CSN9YDR179C 489 nt-0.08□□□□□ -2.42
ABP140Q08641 ULI1YFR026C 510 nt-0.08□□□□□ -2.42
ABP140Q08641 YLR232WYLR232W 348 nt-0.09□□□□□ -2.42
ABP140Q08641 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.09□□□□□ -2.42
ABP140Q08641 COG8YML071C 1824 nt-0.09□□□□□ -2.42
ABP140Q08641 PCC1YKR095W-A 267 nt-0.1□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.1□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 UTP8YGR128C 2142 nt-0.1□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-0.11□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 YLR434CYLR434C 384 nt-0.11□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 YKU70YMR284W 1809 nt-0.12□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 YEL073CYEL073C 324 nt-0.12□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 YHR138CYHR138C 345 nt-0.13□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 YCR022CYCR022C 345 nt-0.14□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 YAR029WYAR029W 225 nt-0.14□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 RPL35AYDL191W 363 nt-0.15□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-0.15□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.15□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 YLR282CYLR282C 342 nt-0.15□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 VPS20YMR077C 666 nt-0.15□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 ATP19YOL077W-A 207 nt-0.15□□□□□ -2.43
ABP140Q08641 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.16□□□□□ -2.44
ABP140Q08641 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-0.16□□□□□ -2.44
ABP140Q08641 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.16□□□□□ -2.44
ABP140Q08641 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.17□□□□□ -2.44
ABP140Q08641 YNL303WYNL303W 348 nt-0.17□□□□□ -2.44
ABP140Q08641 YKL136WYKL136W 399 nt-0.18□□□□□ -2.44
ABP140Q08641 PRP39YML046W 1890 nt-0.18□□□□□ -2.44
ABP140Q08641 YDL158CYDL158C 309 nt-0.19□□□□□ -2.44
ABP140Q08641 YAR053WYAR053W 297 nt-0.19□□□□□ -2.44
ABP140Q08641 PRM3YPL192C 402 nt-0.19□□□□□ -2.44
ABP140Q08641 snR128snR128 126 nt-0.2□□□□□ -2.44
ABP140Q08641 snR8snR8 190 nt-0.22□□□□□ -2.44
ABP140Q08641 YDR210WYDR210W 228 nt-0.23□□□□□ -2.45
ABP140Q08641 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-0.23□□□□□ -2.45
ABP140Q08641 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-0.25□□□□□ -2.45
ABP140Q08641 SNU13YEL026W 381 nt-0.26□□□□□ -2.45
ABP140Q08641 YLR041WYLR041W 321 nt-0.26□□□□□ -2.45
ABP140Q08641 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-0.26□□□□□ -2.45
ABP140Q08641 YPL205CYPL205C 345 nt-0.26□□□□□ -2.45
ABP140Q08641 YER137W-AYER137W-A 306 nt-0.27□□□□□ -2.45
ABP140Q08641 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.27□□□□□ -2.45
ABP140Q08641 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-0.27□□□□□ -2.45
ABP140Q08641 HTB2YBL002W 396 nt-0.28□□□□□ -2.45
ABP140Q08641 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.28□□□□□ -2.45
ABP140Q08641 CSE1YGL238W 2883 nt-0.29□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.31□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 SBH2YER019C-A 267 nt-0.31□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 RPS27BYHR021C 249 nt-0.31□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 BLI1YKL061W 342 nt-0.31□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 YDR366CYDR366C 399 nt-0.32□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 YER079WYER079W 633 nt-0.32□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 YJL007CYJL007C 315 nt-0.32□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.32□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 YDR048CYDR048C 315 nt-0.33□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.33□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 YFL063WYFL063W 456 nt-0.33□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 YGR069WYGR069W 336 nt-0.33□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 EST1YLR233C 2100 nt-0.34□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-0.34□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-0.34□□□□□ -2.46
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