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Protein–RNA interactions for Protein: Q03048
COF1, Cofilin, yeast
Known RBP
Predictions only
Length
143 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
COF1
Q03048
BER1
YLR412W
825 nt
-0.44
□□□□□ -2.48
COF1
Q03048
YNL058C
YNL058C
951 nt
-0.44
□□□□□ -2.48
COF1
Q03048
YNL319W
YNL319W
441 nt
-0.44
□□□□□ -2.48
COF1
Q03048
YDL016C
YDL016C
303 nt
-0.45
□□□□□ -2.48
COF1
Q03048
SEM1
YDR363W-A
270 nt
-0.45
□□□□□ -2.48
COF1
Q03048
YMR307C-A
YMR307C-A
195 nt
-0.45
□□□□□ -2.48
COF1
Q03048
TAR1
YLR154W-C
375 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
COF1
Q03048
HTB2
YBL002W
396 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
COF1
Q03048
YDL011C
YDL011C
324 nt
-0.47
□□□□□ -2.48
COF1
Q03048
ECL1
YGR146C
636 nt
-0.48
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
YJL007C
YJL007C
315 nt
-0.48
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
YPL225W
YPL225W
441 nt
-0.48
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
YPR092W
YPR092W
306 nt
-0.48
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
snR46
snR46
197 nt
-0.48
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
ISF1
YMR081C
1017 nt
-0.49
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
YPL229W
YPL229W
621 nt
-0.49
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
YLR269C
YLR269C
351 nt
-0.5
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
YBL071C
YBL071C
309 nt
-0.5
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
YCR022C
YCR022C
345 nt
-0.51
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
YFR009W-A
YFR009W-A
258 nt
-0.51
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
CSE1
YGL238W
2883 nt
-0.51
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
DIE2
YGR227W
1578 nt
-0.51
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
RAD61
YDR014W
1944 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
YPR002C-A
YPR002C-A
198 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
SEC10
YLR166C
2616 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
HMRA2
YCR096C
360 nt
-0.53
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
YKL083W
YKL083W
615 nt
-0.53
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
GRX5
YPL059W
453 nt
-0.53
□□□□□ -2.49
COF1
Q03048
MPC1
YGL080W
393 nt
-0.54
□□□□□ -2.5
COF1
Q03048
ZEO1
YOL109W
342 nt
-0.54
□□□□□ -2.5
COF1
Q03048
YPL205C
YPL205C
345 nt
-0.54
□□□□□ -2.5
COF1
Q03048
PCF11
YDR228C
1881 nt
-0.56
□□□□□ -2.5
COF1
Q03048
FYV7
YLR068W
456 nt
-0.56
□□□□□ -2.5
COF1
Q03048
YLR287C
YLR287C
1068 nt
-0.56
□□□□□ -2.5
COF1
Q03048
YML007C-A
YML007C-A
111 nt
-0.56
□□□□□ -2.5
COF1
Q03048
YLR282C
YLR282C
342 nt
-0.57
□□□□□ -2.5
COF1
Q03048
YDR426C
YDR426C
378 nt
-0.58
□□□□□ -2.5
COF1
Q03048
YIR030W-A
YIR030W-A
384 nt
-0.58
□□□□□ -2.5
COF1
Q03048
RPS25B
YLR333C
327 nt
-0.58
□□□□□ -2.5
COF1
Q03048
YLR334C
YLR334C
381 nt
-0.58
□□□□□ -2.5
COF1
Q03048
GPI15
YNL038W
690 nt
-0.59
□□□□□ -2.5
COF1
Q03048
YNL303W
YNL303W
348 nt
-0.6
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
YPL068C
YPL068C
882 nt
-0.6
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
YJL120W
YJL120W
324 nt
-0.61
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
YOR192C-C
YOR192C-C
237 nt
-0.61
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
YBR099C
YBR099C
384 nt
-0.61
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
YHR138C
YHR138C
345 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
URB1
YKL014C
5295 nt
-0.63
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
YGR174W-A
YGR174W-A
87 nt
-0.63
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
SNU13
YEL026W
381 nt
-0.64
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
YHR007C-A
YHR007C-A
216 nt
-0.64
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
YBR072C-A
YBR072C-A
162 nt
-0.64
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
YPR170W-A
YPR170W-A
186 nt
-0.64
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
EST1
YLR233C
2100 nt
-0.64
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
YDR354C-A
YDR354C-A
144 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
YJL047C-A
YJL047C-A
135 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
BLI1
YKL061W
342 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
YOR161W-A
YOR161W-A
81 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
COF1
Q03048
YAR047C
YAR047C
321 nt
-0.66
□□□□□ -2.52
COF1
Q03048
YMR158W-B
YMR158W-B
321 nt
-0.66
□□□□□ -2.52
COF1
Q03048
PCC1
YKR095W-A
267 nt
-0.67
□□□□□ -2.52
COF1
Q03048
YHR125W
YHR125W
306 nt
-0.68
□□□□□ -2.52
COF1
Q03048
UTP8
YGR128C
2142 nt
-0.69
□□□□□ -2.52
COF1
Q03048
YLR285C-A
YLR285C-A
171 nt
-0.69
□□□□□ -2.52
COF1
Q03048
YLR456W
YLR456W
615 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
COF1
Q03048
YDR366C
YDR366C
399 nt
-0.71
□□□□□ -2.52
COF1
Q03048
YER084W-A
YER084W-A
513 nt
-0.71
□□□□□ -2.52
COF1
Q03048
CBS1
YDL069C
690 nt
-0.72
□□□□□ -2.52
COF1
Q03048
YJL026C-A
YJL026C-A
222 nt
-0.72
□□□□□ -2.52
COF1
Q03048
YLR041W
YLR041W
321 nt
-0.72
□□□□□ -2.52
COF1
Q03048
YNL067W-B
YNL067W-B
141 nt
-0.72
□□□□□ -2.52
COF1
Q03048
YGL123C-A
YGL123C-A
231 nt
-0.73
□□□□□ -2.53
COF1
Q03048
YIL071W-A
YIL071W-A
477 nt
-0.73
□□□□□ -2.53
COF1
Q03048
AIM29
YKR074W
468 nt
-0.73
□□□□□ -2.53
COF1
Q03048
Q0255
Q0255
1419 nt
-0.75
□□□□□ -2.53
COF1
Q03048
YFL012W
YFL012W
447 nt
-0.76
□□□□□ -2.53
COF1
Q03048
YDL007C-A
YDL007C-A
258 nt
-0.77
□□□□□ -2.53
COF1
Q03048
EAF6
YJR082C
342 nt
-0.78
□□□□□ -2.53
COF1
Q03048
YAR029W
YAR029W
225 nt
-0.79
□□□□□ -2.54
COF1
Q03048
YEL020C-B
YEL020C-B
198 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
COF1
Q03048
AGA2
YGL032C
264 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
COF1
Q03048
YKL100W-A
YKL100W-A
90 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
COF1
Q03048
GLG1
YKR058W
1851 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
COF1
Q03048
YHR130C
YHR130C
336 nt
-0.81
□□□□□ -2.54
COF1
Q03048
YLR264C-A
YLR264C-A
117 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
COF1
Q03048
PRM3
YPL192C
402 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
COF1
Q03048
snR33
snR33
183 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
COF1
Q03048
SDH6
YDR379C-A
240 nt
-0.83
□□□□□ -2.54
COF1
Q03048
tA(UGC)Q
tA(UGC)Q
76 nt
-0.84
□□□□□ -2.54
COF1
Q03048
snR54
snR54
86 nt
-0.84
□□□□□ -2.54
COF1
Q03048
tT(UGU)G1
tT(UGU)G1
72 nt
-0.85
□□□□□ -2.55
COF1
Q03048
tT(UGU)G2
tT(UGU)G2
72 nt
-0.85
□□□□□ -2.55
COF1
Q03048
tT(UGU)P
tT(UGU)P
72 nt
-0.85
□□□□□ -2.55
COF1
Q03048
YFL063W
YFL063W
456 nt
-0.86
□□□□□ -2.55
COF1
Q03048
RPM2
YML091C
3609 nt
-0.87
□□□□□ -2.55
COF1
Q03048
CSN9
YDR179C
489 nt
-0.88
□□□□□ -2.55
COF1
Q03048
BI2
Q0110
1272 nt
-0.88
□□□□□ -2.55
COF1
Q03048
PAU9
YBL108C-A
129 nt
-0.88
□□□□□ -2.55
COF1
Q03048
YKL123W
YKL123W
381 nt
-0.89
□□□□□ -2.55
COF1
Q03048
VPS20
YMR077C
666 nt
-0.89
□□□□□ -2.55
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