Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms