Protein–RNA interactions for Protein: P40422

RPC10, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, yeastyeast

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10P40422 EST1YLR233C 2100 nt-0.8□□□□□ -2.54
RPC10P40422 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.81□□□□□ -2.54
RPC10P40422 YPL182CYPL182C 384 nt-0.81□□□□□ -2.54
RPC10P40422 HUR1YGL168W 333 nt-0.82□□□□□ -2.54
RPC10P40422 CUP1-1YHR053C 186 nt-0.82□□□□□ -2.54
RPC10P40422 CUP1-2YHR055C 186 nt-0.82□□□□□ -2.54
RPC10P40422 MRPS8YMR158W 468 nt-0.82□□□□□ -2.54
RPC10P40422 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.83□□□□□ -2.54
RPC10P40422 POP7YBR167C 423 nt-0.83□□□□□ -2.54
RPC10P40422 YGL230CYGL230C 444 nt-0.84□□□□□ -2.54
RPC10P40422 CMC1YKL137W 336 nt-0.84□□□□□ -2.54
RPC10P40422 YMR254CYMR254C 309 nt-0.84□□□□□ -2.54
RPC10P40422 YNL058CYNL058C 951 nt-0.84□□□□□ -2.54
RPC10P40422 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.85□□□□□ -2.55
RPC10P40422 YJL120WYJL120W 324 nt-0.85□□□□□ -2.55
RPC10P40422 YHR138CYHR138C 345 nt-0.86□□□□□ -2.55
RPC10P40422 BLI1YKL061W 342 nt-0.86□□□□□ -2.55
RPC10P40422 YLR041WYLR041W 321 nt-0.86□□□□□ -2.55
RPC10P40422 YBL062WYBL062W 381 nt-0.86□□□□□ -2.55
RPC10P40422 snR9snR9 187 nt-0.87□□□□□ -2.55
RPC10P40422 MND1YGL183C 660 nt-0.87□□□□□ -2.55
RPC10P40422 YGR025WYGR025W 303 nt-0.87□□□□□ -2.55
RPC10P40422 YLR282CYLR282C 342 nt-0.87□□□□□ -2.55
RPC10P40422 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.87□□□□□ -2.55
RPC10P40422 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.88□□□□□ -2.55
RPC10P40422 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.88□□□□□ -2.55
RPC10P40422 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.88□□□□□ -2.55
RPC10P40422 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.88□□□□□ -2.55
RPC10P40422 GRX5YPL059W 453 nt-0.88□□□□□ -2.55
RPC10P40422 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-0.89□□□□□ -2.55
RPC10P40422 MATALPHA2YCR039C 633 nt-0.89□□□□□ -2.55
RPC10P40422 HMRA2YCR096C 360 nt-0.89□□□□□ -2.55
RPC10P40422 SCEIQ0160 708 nt-0.89□□□□□ -2.55
RPC10P40422 YHL041WYHL041W 450 nt-0.89□□□□□ -2.55
RPC10P40422 SNU13YEL026W 381 nt-0.9□□□□□ -2.55
RPC10P40422 RPM2YML091C 3609 nt-0.9□□□□□ -2.55
RPC10P40422 YCR100CYCR100C 951 nt-0.91□□□□□ -2.56
RPC10P40422 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.91□□□□□ -2.56
RPC10P40422 ZEO1YOL109W 342 nt-0.91□□□□□ -2.56
RPC10P40422 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.92□□□□□ -2.56
RPC10P40422 YML007C-AYML007C-A 111 nt-0.92□□□□□ -2.56
RPC10P40422 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.94□□□□□ -2.56
RPC10P40422 snR36snR36 182 nt-0.94□□□□□ -2.56
RPC10P40422 FYV7YLR068W 456 nt-0.95□□□□□ -2.56
RPC10P40422 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.95□□□□□ -2.56
RPC10P40422 TSC3YBR058C-A 243 nt-0.95□□□□□ -2.56
RPC10P40422 YER079WYER079W 633 nt-0.97□□□□□ -2.56
RPC10P40422 RPS25BYLR333C 327 nt-0.97□□□□□ -2.56
RPC10P40422 YNL303WYNL303W 348 nt-0.97□□□□□ -2.56
RPC10P40422 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-0.97□□□□□ -2.56
RPC10P40422 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.98□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YPL229WYPL229W 621 nt-0.98□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YDR366CYDR366C 399 nt-0.99□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YER175W-AYER175W-A 165 nt-0.99□□□□□ -2.57
RPC10P40422 AGA2YGL032C 264 nt-1□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YDL011CYDL011C 324 nt-1.01□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YKL044WYKL044W 321 nt-1.01□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-1.02□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YIL029CYIL029C 429 nt-1.02□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YJR087WYJR087W 351 nt-1.02□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-1.02□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YLR334CYLR334C 381 nt-1.02□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YDL016CYDL016C 303 nt-1.03□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-1.03□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YDR426CYDR426C 378 nt-1.03□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YKL083WYKL083W 615 nt-1.03□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YPL068CYPL068C 882 nt-1.03□□□□□ -2.57
RPC10P40422 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-1.05□□□□□ -2.58
RPC10P40422 YBL071CYBL071C 309 nt-1.05□□□□□ -2.58
RPC10P40422 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-1.06□□□□□ -2.58
RPC10P40422 COG6YNL041C 2520 nt-1.07□□□□□ -2.58
RPC10P40422 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-1.07□□□□□ -2.58
RPC10P40422 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-1.08□□□□□ -2.58
RPC10P40422 YML100W-AYML100W-A 174 nt-1.08□□□□□ -2.58
RPC10P40422 YJL182CYJL182C 318 nt-1.09□□□□□ -2.58
RPC10P40422 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-1.1□□□□□ -2.59
RPC10P40422 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-1.1□□□□□ -2.59
RPC10P40422 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-1.11□□□□□ -2.59
RPC10P40422 SDH6YDR379C-A 240 nt-1.11□□□□□ -2.59
RPC10P40422 YHR130CYHR130C 336 nt-1.11□□□□□ -2.59
RPC10P40422 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-1.12□□□□□ -2.59
RPC10P40422 PCC1YKR095W-A 267 nt-1.12□□□□□ -2.59
RPC10P40422 YLR269CYLR269C 351 nt-1.13□□□□□ -2.59
RPC10P40422 TAH1YCR060W 336 nt-1.14□□□□□ -2.59
RPC10P40422 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-1.14□□□□□ -2.59
RPC10P40422 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-1.16□□□□□ -2.6
RPC10P40422 snR161snR161 161 nt-1.16□□□□□ -2.6
RPC10P40422 snR49snR49 165 nt-1.16□□□□□ -2.6
RPC10P40422 AIM29YKR074W 468 nt-1.17□□□□□ -2.6
RPC10P40422 YAR029WYAR029W 225 nt-1.17□□□□□ -2.6
RPC10P40422 YER084W-AYER084W-A 513 nt-1.18□□□□□ -2.6
RPC10P40422 YAR047CYAR047C 321 nt-1.19□□□□□ -2.6
RPC10P40422 YFL012WYFL012W 447 nt-1.2□□□□□ -2.6
RPC10P40422 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-1.21□□□□□ -2.6
RPC10P40422 YER053C-AYER053C-A 114 nt-1.22□□□□□ -2.6
RPC10P40422 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.22□□□□□ -2.6
RPC10P40422 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-1.22□□□□□ -2.6
RPC10P40422 YGL182CYGL182C 324 nt-1.23□□□□□ -2.61
RPC10P40422 YLR456WYLR456W 615 nt-1.23□□□□□ -2.61
RPC10P40422 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.23□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.6 ms