RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: P40317
SOK1, Protein SOK1, yeast
Predictions only
Length
901 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SOK1
P40317
TAR1
YLR154W-C
375 nt
0.25
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
SGF11
YPL047W
300 nt
0.25
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
PRP5
YBR237W
2550 nt
0.25
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
YER079W
YER079W
633 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
YJL120W
YJL120W
324 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
YJL127W-A
YJL127W-A
117 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
YJR157W
YJR157W
363 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
PCC1
YKR095W-A
267 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
YOR053W
YOR053W
342 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
PRM3
YPL192C
402 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
YPL205C
YPL205C
345 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
YPL225W
YPL225W
441 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
ESP1
YGR098C
4893 nt
0.23
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
YDL185C-A
YDL185C-A
228 nt
0.23
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
VPS20
YMR077C
666 nt
0.23
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
YPR160W-A
YPR160W-A
81 nt
0.23
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
SPO21
YOL091W
1830 nt
0.22
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
PAA1
YDR071C
576 nt
0.22
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
YER137W-A
YER137W-A
306 nt
0.22
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
RPS25B
YLR333C
327 nt
0.22
□□□□□ -2.37
SOK1
P40317
HMRA2
YCR096C
360 nt
0.21
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
OST4
YDL232W
111 nt
0.21
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
YAR029W
YAR029W
225 nt
0.21
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
YLR202C
YLR202C
327 nt
0.21
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
YBR285W
YBR285W
435 nt
0.21
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
STE5
YDR103W
2754 nt
0.2
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
YHL046W-A
YHL046W-A
327 nt
0.2
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
YOR345C
YOR345C
351 nt
0.2
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
HAL9
YOL089C
3093 nt
0.2
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
PET111
YMR257C
2403 nt
0.19
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
BEM3
YPL115C
3387 nt
0.19
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
YER078W-A
YER078W-A
165 nt
0.19
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
YHR138C
YHR138C
345 nt
0.19
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
COX5B
YIL111W
456 nt
0.19
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
YKL063C
YKL063C
504 nt
0.19
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
PRP42
YDR235W
1635 nt
0.18
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
RPL35A
YDL191W
363 nt
0.18
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
SSS1
YDR086C
243 nt
0.18
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
AGA2
YGL032C
264 nt
0.18
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
tW(UCA)Q
tW(UCA)Q
74 nt
0.18
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
Q0017
Q0017
162 nt
0.18
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
SEC8
YPR055W
3198 nt
0.18
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
tN(GUU)Q
tN(GUU)Q
71 nt
0.17
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
YAL067W-A
YAL067W-A
228 nt
0.17
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
YOR121C
YOR121C
306 nt
0.17
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
snR190
snR190
190 nt
0.17
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
ORC3
YLL004W
1851 nt
0.16
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
VIK1
YPL253C
1944 nt
0.16
□□□□□ -2.38
SOK1
P40317
THO2
YNL139C
4794 nt
0.15
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YDR354C-A
YDR354C-A
144 nt
0.15
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YAR053W
YAR053W
297 nt
0.15
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YLR399W-A
YLR399W-A
105 nt
0.15
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YMR001C-A
YMR001C-A
231 nt
0.15
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
LEE1
YPL054W
906 nt
0.15
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YCR018C-A
YCR018C-A
255 nt
0.14
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YHR007C-A
YHR007C-A
216 nt
0.14
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
HTB2
YBL002W
396 nt
0.14
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YNL324W
YNL324W
396 nt
0.14
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YOR293C-A
YOR293C-A
150 nt
0.14
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YNL054W-B
YNL054W-B
5250 nt
0.13
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YDR371C-A
YDR371C-A
105 nt
0.13
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YIL115W-A
YIL115W-A
372 nt
0.13
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YLR264C-A
YLR264C-A
117 nt
0.13
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
COG8
YML071C
1824 nt
0.13
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
RCO1
YMR075W
2055 nt
0.12
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YOL013W-A
YOL013W-A
192 nt
0.12
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YPR092W
YPR092W
306 nt
0.12
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
ULI1
YFR026C
510 nt
0.11
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
RPS26A
YGL189C
360 nt
0.11
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YJL026C-A
YJL026C-A
222 nt
0.11
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YMR307C-A
YMR307C-A
195 nt
0.11
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
MLP1
YKR095W
5628 nt
0.11
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YDR048C
YDR048C
315 nt
0.1
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YNL146W
YNL146W
303 nt
0.1
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
NNF2
YGR089W
2811 nt
0.09
□□□□□ -2.39
SOK1
P40317
YAL068W-A
YAL068W-A
255 nt
0.09
□□□□□ -2.4
SOK1
P40317
COY1
YKL179C
2040 nt
0.09
□□□□□ -2.4
SOK1
P40317
BUL2
YML111W
2763 nt
0.09
□□□□□ -2.4
SOK1
P40317
YLR282C
YLR282C
342 nt
0.08
□□□□□ -2.4
SOK1
P40317
YOR161W-A
YOR161W-A
81 nt
0.08
□□□□□ -2.4
SOK1
P40317
YCR022C
YCR022C
345 nt
0.07
□□□□□ -2.4
SOK1
P40317
RPS27B
YHR021C
249 nt
0.07
□□□□□ -2.4
SOK1
P40317
YKL136W
YKL136W
399 nt
0.07
□□□□□ -2.4
SOK1
P40317
NIP1
YMR309C
2439 nt
0.07
□□□□□ -2.4
SOK1
P40317
YGR035C
YGR035C
351 nt
0.05
□□□□□ -2.4
SOK1
P40317
BIL1
YOR304C-A
231 nt
0.05
□□□□□ -2.4
SOK1
P40317
YLR154W-F
YLR154W-F
141 nt
0.04
□□□□□ -2.4
SOK1
P40317
YLR222C-A
YLR222C-A
231 nt
0.04
□□□□□ -2.4
SOK1
P40317
COX12
YLR038C
252 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SOK1
P40317
snR60
snR60
104 nt
0.01
□□□□□ -2.41
SOK1
P40317
YGL123C-A
YGL123C-A
231 nt
0.01
□□□□□ -2.41
SOK1
P40317
YHR131W-A
YHR131W-A
246 nt
0.01
□□□□□ -2.41
SOK1
P40317
YLL006W-A
YLL006W-A
177 nt
0.01
□□□□□ -2.41
SOK1
P40317
YLL019W-A
YLL019W-A
93 nt
0.01
□□□□□ -2.41
SOK1
P40317
YPR016W-A
YPR016W-A
261 nt
0.01
□□□□□ -2.41
SOK1
P40317
SOV1
YMR066W
2697 nt
0
□□□□□ -2.41
SOK1
P40317
YEL020C-B
YEL020C-B
198 nt
0
□□□□□ -2.41
SOK1
P40317
YGR069W
YGR069W
336 nt
0
□□□□□ -2.41
SOK1
P40317
Q0144
Q0144
330 nt
0
□□□□□ -2.41
SOK1
P40317
YLR041W
YLR041W
321 nt
0
□□□□□ -2.41
First
Previous
68
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8 ms