Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2H1P32780 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2H1P32780 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2H1P32780 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2H1P32780 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2H1P32780 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2H1P32780 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2H1P32780 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2H1P32780 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2H1P32780 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2H1P32780 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2H1P32780 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms