Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
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PTPRMP28827 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
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