Protein–RNA interactions for Protein: P25038

IFM1, Translation initiation factor IF-2, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IFM1P25038 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
IFM1P25038 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
IFM1P25038 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
IFM1P25038 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.59□□□□□ -2.31
IFM1P25038 BIL1YOR304C-A 231 nt0.59□□□□□ -2.31
IFM1P25038 YDR048CYDR048C 315 nt0.58□□□□□ -2.32
IFM1P25038 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.58□□□□□ -2.32
IFM1P25038 UTP10YJL109C 5310 nt0.58□□□□□ -2.32
IFM1P25038 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.57□□□□□ -2.32
IFM1P25038 YML002WYML002W 2214 nt0.56□□□□□ -2.32
IFM1P25038 INA22YIR024C 651 nt0.56□□□□□ -2.32
IFM1P25038 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.55□□□□□ -2.32
IFM1P25038 YFL019CYFL019C 354 nt0.54□□□□□ -2.32
IFM1P25038 YOR029WYOR029W 336 nt0.54□□□□□ -2.32
IFM1P25038 COG8YML071C 1824 nt0.53□□□□□ -2.32
IFM1P25038 PAA1YDR071C 576 nt0.53□□□□□ -2.32
IFM1P25038 FYV10YIL097W 1551 nt0.53□□□□□ -2.33
IFM1P25038 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.52□□□□□ -2.33
IFM1P25038 RPL26BYGR034W 384 nt0.51□□□□□ -2.33
IFM1P25038 YAF9YNL107W 681 nt0.51□□□□□ -2.33
IFM1P25038 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.5□□□□□ -2.33
IFM1P25038 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.49□□□□□ -2.33
IFM1P25038 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.49□□□□□ -2.33
IFM1P25038 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.49□□□□□ -2.33
IFM1P25038 PRP5YBR237W 2550 nt0.49□□□□□ -2.33
IFM1P25038 YOR218CYOR218C 420 nt0.48□□□□□ -2.33
IFM1P25038 YDR102CYDR102C 333 nt0.47□□□□□ -2.33
IFM1P25038 YMR321CYMR321C 318 nt0.47□□□□□ -2.33
IFM1P25038 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.46□□□□□ -2.34
IFM1P25038 YPR012WYPR012W 255 nt0.46□□□□□ -2.34
IFM1P25038 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.46□□□□□ -2.34
IFM1P25038 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.46□□□□□ -2.34
IFM1P25038 RPS27BYHR021C 249 nt0.45□□□□□ -2.34
IFM1P25038 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.45□□□□□ -2.34
IFM1P25038 snR190snR190 190 nt0.45□□□□□ -2.34
IFM1P25038 SEC8YPR055W 3198 nt0.45□□□□□ -2.34
IFM1P25038 snR60snR60 104 nt0.44□□□□□ -2.34
IFM1P25038 OST4YDL232W 111 nt0.44□□□□□ -2.34
IFM1P25038 COX5BYIL111W 456 nt0.44□□□□□ -2.34
IFM1P25038 YMR160WYMR160W 2451 nt0.44□□□□□ -2.34
IFM1P25038 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.43□□□□□ -2.34
IFM1P25038 STF2YGR008C 255 nt0.43□□□□□ -2.34
IFM1P25038 PAU12YGR294W 363 nt0.43□□□□□ -2.34
IFM1P25038 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.43□□□□□ -2.34
IFM1P25038 YOR345CYOR345C 351 nt0.43□□□□□ -2.34
IFM1P25038 YSP1YHR155W 3687 nt0.43□□□□□ -2.34
IFM1P25038 VIK1YPL253C 1944 nt0.42□□□□□ -2.34
IFM1P25038 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.42□□□□□ -2.34
IFM1P25038 HAL9YOL089C 3093 nt0.42□□□□□ -2.34
IFM1P25038 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.41□□□□□ -2.34
IFM1P25038 PRP42YDR235W 1635 nt0.4□□□□□ -2.35
IFM1P25038 SBH1YER087C-B 249 nt0.4□□□□□ -2.35
IFM1P25038 HUG1YML058W-A 207 nt0.4□□□□□ -2.35
IFM1P25038 RPS30BYOR182C 192 nt0.4□□□□□ -2.35
IFM1P25038 YPR197CYPR197C 564 nt0.4□□□□□ -2.35
IFM1P25038 HTL1YCR020W-B 237 nt0.39□□□□□ -2.35
IFM1P25038 YIL032CYIL032C 357 nt0.39□□□□□ -2.35
IFM1P25038 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.39□□□□□ -2.35
IFM1P25038 PET111YMR257C 2403 nt0.39□□□□□ -2.35
IFM1P25038 YPR092WYPR092W 306 nt0.38□□□□□ -2.35
IFM1P25038 COY1YKL179C 2040 nt0.38□□□□□ -2.35
IFM1P25038 ULI1YFR026C 510 nt0.37□□□□□ -2.35
IFM1P25038 YKL136WYKL136W 399 nt0.36□□□□□ -2.35
IFM1P25038 YLR282CYLR282C 342 nt0.36□□□□□ -2.35
IFM1P25038 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.36□□□□□ -2.35
IFM1P25038 ABF2YMR072W 552 nt0.35□□□□□ -2.35
IFM1P25038 CSE2YNR010W 450 nt0.35□□□□□ -2.35
IFM1P25038 snR36snR36 182 nt0.35□□□□□ -2.35
IFM1P25038 UTP20YBL004W 7482 nt0.35□□□□□ -2.35
IFM1P25038 ULP2YIL031W 3105 nt0.34□□□□□ -2.35
IFM1P25038 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.34□□□□□ -2.36
IFM1P25038 FMP27YLR454W 7887 nt0.34□□□□□ -2.36
IFM1P25038 YOR015WYOR015W 360 nt0.34□□□□□ -2.36
IFM1P25038 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.34□□□□□ -2.36
IFM1P25038 YFL063WYFL063W 456 nt0.33□□□□□ -2.36
IFM1P25038 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.33□□□□□ -2.36
IFM1P25038 YCR022CYCR022C 345 nt0.32□□□□□ -2.36
IFM1P25038 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.32□□□□□ -2.36
IFM1P25038 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.32□□□□□ -2.36
IFM1P25038 ORC3YLL004W 1851 nt0.32□□□□□ -2.36
IFM1P25038 BEM3YPL115C 3387 nt0.32□□□□□ -2.36
IFM1P25038 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.31□□□□□ -2.36
IFM1P25038 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.31□□□□□ -2.36
IFM1P25038 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.31□□□□□ -2.36
IFM1P25038 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.31□□□□□ -2.36
IFM1P25038 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.31□□□□□ -2.36
IFM1P25038 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.31□□□□□ -2.36
IFM1P25038 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.31□□□□□ -2.36
IFM1P25038 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.31□□□□□ -2.36
IFM1P25038 YFL032WYFL032W 321 nt0.31□□□□□ -2.36
IFM1P25038 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.3□□□□□ -2.36
IFM1P25038 ATP6Q0085 780 nt0.3□□□□□ -2.36
IFM1P25038 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.3□□□□□ -2.36
IFM1P25038 YGR069WYGR069W 336 nt0.3□□□□□ -2.36
IFM1P25038 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.3□□□□□ -2.36
IFM1P25038 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.29□□□□□ -2.36
IFM1P25038 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.29□□□□□ -2.36
IFM1P25038 YGL149WYGL149W 306 nt0.29□□□□□ -2.36
IFM1P25038 RPS26AYGL189C 360 nt0.28□□□□□ -2.36
IFM1P25038 NNF2YGR089W 2811 nt0.28□□□□□ -2.36
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