Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASTP20810 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CASTP20810 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASTP20810 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CASTP20810 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASTP20810 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASTP20810 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASTP20810 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASTP20810 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASTP20810 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASTP20810 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASTP20810 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASTP20810 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASTP20810 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CASTP20810 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASTP20810 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASTP20810 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASTP20810 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASTP20810 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASTP20810 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CASTP20810 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASTP20810 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASTP20810 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CASTP20810 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASTP20810 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASTP20810 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASTP20810 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASTP20810 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASTP20810 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASTP20810 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASTP20810 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASTP20810 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASTP20810 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASTP20810 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASTP20810 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASTP20810 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASTP20810 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASTP20810 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CASTP20810 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASTP20810 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASTP20810 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASTP20810 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASTP20810 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms