Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC9A1P19634 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms