Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms