Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA1P15085 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA1P15085 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA1P15085 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA1P15085 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA1P15085 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA1P15085 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA1P15085 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA1P15085 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA1P15085 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA1P15085 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA1P15085 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA1P15085 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA1P15085 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA1P15085 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA1P15085 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA1P15085 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA1P15085 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA1P15085 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA1P15085 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA1P15085 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA1P15085 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA1P15085 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA1P15085 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CPA1P15085 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CPA1P15085 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CPA1P15085 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA1P15085 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA1P15085 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA1P15085 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms