Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PF4V1P10720 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms