Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERI3O43414 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERI3O43414 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERI3O43414 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ERI3O43414 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ERI3O43414 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERI3O43414 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERI3O43414 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERI3O43414 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ERI3O43414 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERI3O43414 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERI3O43414 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERI3O43414 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERI3O43414 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERI3O43414 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERI3O43414 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERI3O43414 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERI3O43414 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERI3O43414 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERI3O43414 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms