Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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BCKDKO14874 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BCKDKO14874 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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