Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3KR12 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3KR12 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3KR12 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3KR12 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3KR12 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3KR12 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3KR12 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3KR12 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3KR12 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3KR12 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3KR12 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms