Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms