Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEMA6NI47 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms