Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms