Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157714.1-201ENST00000448964 625 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01280-201ENST00000449783 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01985-201ENST00000450746 436 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGGT1BP1-201ENST00000455321 1023 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC239859.3-201ENST00000456469 408 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF195-220ENST00000528796 881 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7E15P-201ENST00000533484 967 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCF1-202ENST00000534938 794 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133372.2-202ENST00000549360 768 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026111.1-201ENST00000551090 1195 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX5AP2-201ENST00000554418 394 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC055876.4-201ENST00000562515 712 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3911-201ENST00000577791 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JPT1-211ENST00000581874 517 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024619.3-201ENST00000582196 323 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4450-201ENST00000583589 65 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF559-205ENST00000586255 1016 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022239.4-201ENST00000602626 504 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4435-2HG-217ENST00000604981 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF678-205ENST00000608949 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPARGC1A-216ENST00000612355 936 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPARGC1A-218ENST00000617484 1026 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RANBP2-205ENST00000629728 156 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138831.3-201ENST00000623656 1458 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL21-202ENST00000311549 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP1LC3C-201ENST00000357246 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAV8-6-201ENST00000390443 561 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAV20-201ENST00000390448 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS10-203ENST00000392865 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL4A-202ENST00000396662 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD3J-201ENST00000408473 190 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UPF3AP1-201ENST00000413731 1126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTG1P24-201ENST00000423783 877 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353653.1-202ENST00000435177 539 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097358.1-201ENST00000438827 582 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093166.1-201ENST00000442243 330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PET100-201ENST00000456958 219 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590326.1-201ENST00000460857 334 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000926.2-201ENST00000469983 358 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL250P-201ENST00000475154 258 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084878.1-201ENST00000480555 648 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHVII-1-1-201ENST00000517907 180 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAP30L-AS1-204ENST00000524264 1039 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCED1B-AS1-204ENST00000547851 780 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUPT16H-204ENST00000555943 915 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009432.1-201ENST00000560391 648 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02137-201ENST00000561906 644 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC130651.2-201ENST00000573856 536 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098850.2-201ENST00000578710 686 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005210.1-201ENST00000583659 544 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008737.3-201ENST00000601661 221 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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