Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC002066.1-202ENST00000439070 699 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC093157.1-202ENST00000446527 1045 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC007879.2-201ENST00000454444 551 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AP001782.1-202ENST00000527774 445 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC025252.2-201ENST00000537470 502 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 GSTM3-206ENST00000540225 678 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC084033.2-201ENST00000551532 967 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC023794.4-201ENST00000551732 754 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 TUBAP4-201ENST00000569261 416 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC136624.3-201ENST00000571660 567 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC061975.4-201ENST00000578466 776 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 DSG1-AS1-204ENST00000581856 669 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ZNF208-202ENST00000597040 781 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 INTS6-AS1-218ENST00000598905 906 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL121583.1-201ENST00000612444 682 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CRYAB-216ENST00000616970 977 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PFN1P2-202ENST00000621347 397 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 GAS2-210ENST00000630668 674 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CPB1-201ENST00000282957 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL354719.2-201ENST00000429530 1454 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 OR10AD1-201ENST00000310248 1305 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC092979.1-201ENST00000488190 1414 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SMAD5-AS1-201ENST00000297163 1816 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RNU1-21P-201ENST00000363327 163 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 NXT2-204ENST00000372107 937 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CBWD1-207ENST00000382447 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RPL4P4-201ENST00000422486 1284 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC110995.1-202ENST00000422914 860 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 GAPDHP73-201ENST00000423411 1007 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL162724.2-201ENST00000426157 308 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC007849.1-201ENST00000469794 513 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 LINC02024-202ENST00000493545 483 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC138866.1-201ENST00000514522 497 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 C11orf70-205ENST00000534360 520 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 MS4A12-205ENST00000537076 1019 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC092133.1-201ENST00000565828 719 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 LINC01989-201ENST00000566930 1081 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 MCM3AP-AS1-207ENST00000588753 589 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC108861.1-201ENST00000611634 585 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC244669.1-201ENST00000616141 715 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms