Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 LINC01811-202ENST00000424786 787 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AL121885.2-201ENST00000440255 819 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 OR7E102P-201ENST00000448855 1015 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 PRKG1-AS1-203ENST00000452247 886 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC109454.1-201ENST00000471205 498 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AF186996.3-201ENST00000509527 964 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 NUTF2P2-201ENST00000551207 384 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 BMS1P15-201ENST00000554269 1141 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AL137802.2-201ENST00000562878 1110 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC099508.2-201ENST00000563098 510 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC099524.1-206ENST00000568131 407 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC239809.3-218ENST00000616018 1023 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC005790.1-201ENST00000619774 450 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AL353898.3-201ENST00000624679 1755 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 OR52K3P-202ENST00000641797 1729 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 FAM122C-202ENST00000370785 1344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 CKMT2-AS1-206ENST00000511495 585 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AP000873.4-201ENST00000528133 905 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC079456.1-201ENST00000624010 480 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC092979.1-201ENST00000488190 1414 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CABYR-206ENST00000463087 1792 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 NXT2-204ENST00000372107 937 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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