Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 TM2D2-203ENST00000456845 3295 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AP003066.1-201ENST00000527528 1647 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 OR7E11P-202ENST00000642027 1491 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 WDR89-204ENST00000620954 2935 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 MIR106B-201ENST00000385301 82 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 LL22NC01-81G9.3-201ENST00000400221 992 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC011753.4-201ENST00000417974 311 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 RBMY2YP-201ENST00000423333 912 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC003071.2-201ENST00000423857 315 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AL365295.1-204ENST00000425648 553 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC004160.2-201ENST00000425837 563 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 RPL5P4-201ENST00000434805 886 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 LINC02243-201ENST00000441841 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC239860.1-201ENST00000444680 1270 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 LINC00499-203ENST00000510736 587 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC087280.1-201ENST00000530632 1003 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 LINC02325-203ENST00000554862 733 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC093074.1-201ENST00000590280 556 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC018737.1-201ENST00000603900 204 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AL136141.1-201ENST00000605780 369 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AL731533.2-201ENST00000607898 578 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AL121583.1-201ENST00000612444 682 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC130456.1-201ENST00000565085 1363 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 EEF1A1P2-201ENST00000553854 1447 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 OR1K1-201ENST00000277309 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 DEFB105B-201ENST00000335510 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTGFRP43088 CEP41-203ENST00000343969 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms