Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 SPATA19-201ENST00000299140 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RPSAP42-201ENST00000403415 878 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL031584.2-201ENST00000420585 767 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RPL23AP34-201ENST00000423483 410 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC003071.2-201ENST00000423857 315 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 KLF7-IT1-201ENST00000428777 655 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 LINC01805-201ENST00000436433 572 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 LYSMD1-202ENST00000440902 1003 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC098828.2-201ENST00000452342 573 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL035660.2-201ENST00000461248 556 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC090680.1-201ENST00000464696 860 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 QTRT2-215ENST00000493014 1046 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC079768.1-201ENST00000503181 711 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC022796.1-202ENST00000531882 477 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 NDFIP1P1-201ENST00000543144 525 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC084033.2-201ENST00000551532 967 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 LINC01588-213ENST00000557142 492 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CYB5B-205ENST00000561792 823 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC093074.1-201ENST00000590280 556 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 Z98949.1-208ENST00000597614 816 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL627309.5-203ENST00000466557 1301 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CWC15-201ENST00000279839 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 GNPAT-201ENST00000366647 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CENPN-205ENST00000439957 1699 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 WDR89-204ENST00000620954 2935 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 SMR3A-201ENST00000226460 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC133644.1-201ENST00000398171 937 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC006017.1-201ENST00000424630 673 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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PDK4Q16654 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL157402.1-201ENST00000429469 363 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL049651.1-201ENST00000440798 719 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC145625.1-201ENST00000441444 592 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 TTC21B-AS1-202ENST00000443032 544 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CASK-AS1-201ENST00000451126 515 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RPL22L1-202ENST00000463836 506 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RN7SL55P-201ENST00000464534 297 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RN7SL621P-201ENST00000472565 299 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 LINC01096-201ENST00000501050 1263 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC083841.1-201ENST00000523657 670 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AP003499.1-201ENST00000527217 574 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AP001782.1-202ENST00000527774 445 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL590560.1-203ENST00000544342 408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 SRMP2-201ENST00000553832 916 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC009021.1-201ENST00000566098 375 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 MIR3137-201ENST00000577367 75 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC061975.4-201ENST00000578466 776 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CDRT8-201ENST00000579752 467 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC074135.1-201ENST00000594318 581 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 IGKV1OR1-1-201ENST00000613775 347 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 MIR6761-201ENST00000617899 72 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC012100.3-201ENST00000624738 575 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 STK32A-209ENST00000626951 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 TMEM55A-206ENST00000630164 171 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 MFSD8-234ENST00000641503 1082 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL513523.1-201ENST00000417868 1309 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 EEF1A1P15-201ENST00000395772 1408 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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