Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 PIK3C3-204ENST00000586545 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 GABRB3-225ENST00000638099 2752 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 GSTM2-204ENST00000369831 1730 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 DTNA-233ENST00000601125 1931 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 NUSAP1-210ENST00000560177 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 METTL2A-204ENST00000616852 3150 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 NLRP9-201ENST00000332836 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 TMPPE-202ENST00000416695 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AHCYP5-201ENST00000331585 1238 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RIT1-201ENST00000368322 855 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CREM-213ENST00000374734 711 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SNORA30-201ENST00000384028 129 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 TDGF1P4-201ENST00000401555 520 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 TMSB10P1-201ENST00000415070 132 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL031733.1-201ENST00000422817 455 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 EIF4A1P10-201ENST00000428832 1216 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 HIPK1-AS1-203ENST00000441071 571 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RPL37A-204ENST00000441179 529 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC118653.1-201ENST00000442627 561 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC00265-202ENST00000448955 468 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CASK-AS1-201ENST00000451126 515 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC009022.1-201ENST00000472115 496 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CREM-231ENST00000479070 939 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC02021-203ENST00000514145 569 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 DACT3-AS1-202ENST00000525008 496 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 OR4A9P-201ENST00000526326 944 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SLC22A10-203ENST00000526800 699 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC087521.3-201ENST00000528226 553 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 DCN-215ENST00000550099 719 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC009779.4-201ENST00000554248 611 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC004816.1-202ENST00000557691 629 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 JPT1-211ENST00000581874 517 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CD209-208ENST00000593821 807 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 GMFG-210ENST00000601387 497 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL034428.1-202ENST00000613736 625 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 FAM74A6-203ENST00000615956 481 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.192-201ENST00000616260 286 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC239859.6-201ENST00000622095 213 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 REST-209ENST00000622863 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC048380.3-201ENST00000623145 796 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RHOXF1P2-201ENST00000635431 502 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 DHRS9-202ENST00000412271 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CEACAM5-208ENST00000615021 1694 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CADPS-220ENST00000613879 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SLC22A10-201ENST00000332793 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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