Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KIF3AQ9Y496 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF3AQ9Y496 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms